Автор: 
Лаборатория биомедицинской геномики в IRB Barcelona разработала вычислительный инструмент на база машинного обучения, который определяет мутации драйвера рака для каждого типа опухоли. Эта и другие разработки, произведённые той же лабораторией, направлены на ускорение исследований рака и предоставляют инструменты, которые помогут онкологам выбрать лучшее лечение для каждого пациента. Исследование опубликовано в журнале Nature.
В предыдущей работе, уже доступной научному и медицинскому сообществу, лаборатория разработала метод определения генов, ответственных за возникновение, прогрессирование и распространение рака.
«BoostDM идёт дальше: он моделирует каждую возможную мутацию в каждом гене для определённого типа рака и указывает, какие из них являются ключевыми в процессе рака. Эта информация помогает нам понять, как опухоль возникает на молекулярном уровне, и может облегчить принятие решения относительно наиболее подходящей терапии для пациента. Кроме того, инструмент поможет лучше понять начальные процессы развития опухоли в разных тканях», — объясняет доктор Лопес-Бигас, руководитель лаборатории биомедицинской геномики.
Новый инструмент интегрирован в платформу IntOGen, которая разработана той же лабораторией и предназначена для использования научным и медицинским сообществом в исследовательских проектах, а также в интерпретатор генома рака, более ориентированный на клиническую практику принятие решения врачами-онкологами. BoostDM в настоящее время работает с мутационными профилями 28 000 проанализированных геномов 66 типов рака. Возможности BoostDM будут расти в результате ожидаемого увеличения общедоступных геномов рака.
