27.11.2021
Наш канал в Telegram: https://t.me/berzaru

Нейросеть научилась искать самые опасные мутации COVID-19

Опасные мутации COVID-19 ищет нейросеть

Исследователи из Пенсильванского университета создали новую структуру, предсказывающую аминокислотные изменения в спайковом белке вируса, которые могут сделать коронавирус еще заранее. Новый инструмент может предупредить потенциально опасные варианты развития вируса, которые будут связываться с клетками человека ещё активнее. Если биологи будут заранее знать о возможных мутациях, это поможет легче бороться с ними. Исследование опубликовано в журнале PNAS.

Авторы новой работы использовали двухэтапную вычислительную процедуру, чтобы создать модель для прогнозирования изменений в аминокислотах — это строительный материал для всех белков в организме. Изменения могут произойти в процессе связывания рецепторов (RBD) спайкового белка SARS-CoV-2. Это повлияет на способность вируса связываться с рецепторами ACE2 клеток человека и других животных.

Во время работы исследователи обучили нейросеть на экспериментальных данных об активности нового типа коронавируса в зависимости от изменений в одной аминокислоте. Они обнаружили, что могут с точностью около 80% предсказать, улучшат или ухудшат определённые изменения аминокислот способность SARS-CoV-2 заражать людей и животных. Модель также предсказала, как изменения в аминокислотах SARS-CoV-2 отразились на активности альфа, бета, гамма и дельта вариантов.